Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPBD1B2RD01 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms