Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A8MVJ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
A8MVJ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms