Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPIPB5A8MRT5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms