Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms