Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCNX2A6NKB5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms