Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms