Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HELTA6NFD8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms