Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms