Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB4A4D0S4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms