Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms