Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms