Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RQF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A0U1RQF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms