Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SFI3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms