Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CNTN3Q9P232 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CNTN3Q9P232 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CNTN3Q9P232 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CNTN3Q9P232 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CNTN3Q9P232 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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