Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NHSL2-208ENST00000639939 3402 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL21A1-201ENST00000244728 4339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 LOXHD1-211ENST00000579038 3632 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL403P-201ENST00000481783 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC140658.1-201ENST00000563019 346 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAP31P2-201ENST00000563143 399 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAP31P1-201ENST00000565437 385 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms