Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RNF20Q5VTR2 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RNF20Q5VTR2 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RNF20Q5VTR2 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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