Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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CCINQ13939 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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