Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC5A11-210ENST00000568579 2139 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC084759.3-201ENST00000624468 3944 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 VIPAS39-201ENST00000327028 2614 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 YPEL4-203ENST00000524669 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MTHFD2P3-201ENST00000423135 221 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AL033527.1-201ENST00000446772 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073465.3-201ENST00000448468 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPCP8-201ENST00000514820 211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR200CHG-201ENST00000537269 350 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015688.1-201ENST00000584894 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 CARMN-212ENST00000614896 536 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC141557.2-201ENST00000621330 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DMD-212ENST00000378723 4645 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-9Q9BYP9 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms