Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf45-201ENST00000310799 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDHL-203ENST00000432695 3383 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MTBP-201ENST00000305949 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ST7L-203ENST00000360743 4206 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR9-201ENST00000360658 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MLC1-202ENST00000395876 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5BA1P-202ENST00000641215 5464 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP11B2-201ENST00000323110 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561A3-201ENST00000294072 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-205ENST00000562871 4514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC23-201ENST00000262074 3316 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-228ENST00000636926 5436 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL135905.1-201ENST00000416120 801 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073626.2-201ENST00000449443 316 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms