Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms