Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FAM46AQ96IP4 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM46AQ96IP4 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms