Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQ87 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQ87 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQ87 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQ87 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms