Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
R4GMQ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms