Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms