Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP16Q9Y5T5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms