Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms