Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms