Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN3Q9Y4C0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms