Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms