Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms