Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-11Q9UQG0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-11Q9UQG0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms