Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms