Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms