Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF8Q9UPP1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms