Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms