Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZMYND8Q9ULU4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZMYND8Q9ULU4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms