Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms