Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF346Q9UL40 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms