Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms