Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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