Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN11AQ9UI33 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN11AQ9UI33 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms