Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX20Q9UHI6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX20Q9UHI6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms