Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGXB4Q9UGU5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms