Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCF2Q9UG63 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms