Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA6Q9UF33 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms