Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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