Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD2Q9UBB5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms