Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms