Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms