Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABP1Q9NZU7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP1Q9NZU7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms